內部檢舉人揭露局內有與女性酷刑研究所相關的叛徒後,特別內部事務調查小組展開了秘密調查。這些令人聞風喪膽的成員被稱為“幽靈”,他們秘密潛入各部門進行臥底調查,不為人知。岡島亞美(黑木鬱美飾)是一名入職二年級的新人調查員,她被派往國際犯罪調查總部,隱瞞「幽靈」的身份,作為神樂坂正佐的繼任者被派往國際犯罪調查總部。